Von 1966 bis 1968 arbeitete er zunächst kommissarisch als Direktor des kunstgeschichtlichen Institutes, danach bis 1973 als stellvertretender Direktor der Sektion Ästhetik und Kunstwissenschaften, ab 1977 als Leiter des Wissenschaftsbereiches Kunstwissenschaft.
Peter H. Feist war ab 1968 Mitglied des Zentralvorstandes des Verbandes Bildender Künstler der DDR (VBK). Im September 1972 wurde er zum Ordentlichen Mitglied der Akademie der Künste der DDR ernannt und ab 1974 war er korrespondierendes Mitglied der Akademie der Wissenschaften der DDR. 1975 und 1980 wurde er mit dem Nationalpreis der DDR geehrt. Im April 1988 wurde er mit dem Vaterländischen Verdienstorden in Bronze ausgezeichnet.
Von 1982 bis zu seinem Vorruhestand 1990 leitete Peter H. Feist das Institut für Ästhetik und Kunstwissenschaften der Akademie der Wissenschaften der DDR. Seitdem war er weiterhin publizistisch tätig und aktives Mitglied der Leibniz-Sozietät der Wissenschaften zu Berlin e.V.